Ingvild Elise Bjerke

Postdoktor - Nevrale systemer
Bilde av Ingvild Elise Bjerke
English version of this page
Brukernavn
Besøksadresse Sognsvannsveien 9 Domus Medica 0372 Oslo
Postadresse Postboks 1105 Blindern 0317 Oslo

Faglige interesser

Jeg forsker på utviklingen av musehjernens anatomi, og kombinerer studier av dette med moderne verktøy for nevroinformatikk. Jeg er opptatt av Open Science og all data fra min forskning deles åpent.

Ekspertise:

  • Immunhistokjemi
  • Analyse av mikroskopiske bilder
  • Celletelling
  • Nevroinformatikk
  • Hjerneatlas
  • Hjerneanatomi

Undervisning

  • IMB9345 – Neuroscience data integration through use of digital brain atlases

Bakgrunn

  • PhD Neuroscience, University of Oslo, Norway
  • MSc Neuroscience, Norwegian University of Science and Technology, Norway

Priser

 

Publikasjoner

Se alle arbeider i Cristin

  • Puchades, Maja Amedjkouh; Yates, Sharon Christine; Bjerke, Ingvild Elise & Carey, Harry (2023). Rodent atlasing tools and the QUINT workflow.
  • Leergaard, Trygve B.; Bjerke, Ingvild Elise; Bjaalie, Jan G.; Palomero-Gallagher, Nicola; Puchades, Maja & Carey, Harry [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2022). Neuroscience data integration through use of digital brain atlases .
  • Bjerke, Ingvild Elise; Imad, Jala; Clascá, Francisco; Groenewegen, Henk J.; Bjaalie, Jan G. & Leergaard, Trygve Brauns (2022). Waxholm Space atlas of the Sprague Dawley rat brain version 4: A volumetric atlas enabling data integration and analysis.
  • Bjerke, Ingvild Elise (2022). Mouse and rat brain atlases: Registering and analysing rodent brain data .
  • Bjerke, Ingvild Elise; Leergaard, Trygve B.; Bjaalie, Jan G. & Kim, Jee Hyun (2022). Quantitative map of dopamine 1- and 2-receptor positive cells in the developing mouse forebrain.
  • Leergaard, Trygve B.; Puchades, Maja ; Kleven, Heidi & Bjerke, Ingvild Elise (2022). HBP Brain Matters webinar #12 "Rodent Brain Atlasing".
  • Bjerke, Ingvild Elise; Cullity, Ellen Rose; Kjelsberg, Kasper; Charan, Kristel; Leergaard, Trygve B. & Kim, Jee Hyun (2022). Map of dopamine 1- and 2-receptor positive cells in the developing mouse forebrain.
  • Leergaard, Trygve B.; Bjerke, Ingvild Elise; Palomero-Gallagher, Nicola; Witter, Menno; Dickscheid, Timo & Puchades, Maja [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2021). Neuroscience data integration through use of digital brain atlases.
  • Puchades, Maja ; Yates, Sharon Christine; Bjerke, Ingvild Elise; Groeneboom, Nicolaas; Csucs, Gergely & Leergaard, Trygve B. [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2021). Implementing the QUINT workflow for spatial quantitative analysis of labelling in mice and rats.
  • Reiten, Ingrid; Schlegel, Ulrike; Blixhavn, Camilla Hagen; Andersson, Krister Andreas; Aasebø, Ida Elisabeth Jørgensen & Yates, Sharon Christine [Vis alle 12 forfattere av denne artikkelen] (2020). Data sharing through the online EBRAINS platform: a new service for brain research.
  • Andersson, Krister Andreas; Blixhavn, Camilla Hagen; Zehl, Lyuba; Zarfarnia, Sara; Köhnen, Stefan & Hilverling, Anna [Vis alle 19 forfattere av denne artikkelen] (2019). Resources for making neuroscience data FAIR. The Human Brain Project invites researchers to share, find, and use data via the new EBRAINS infrastructure.
  • Andersson, Krister Andreas; Blixhavn, Camilla Hagen; Kleven, Heidi; Zehl, Lyuba; Bjerke, Ingvild Elise & Schmid, Oliver [Vis alle 17 forfattere av denne artikkelen] (2019). Neuroinformatics platform for making neuroscience data Findable, Accessible, Interoperable, and Reuseable.
  • Schlegel, Ulrike; Blixhavn, Camilla Hagen; Andersson, Krister Andreas; Yates, Sharon Christine; Øvsthus, Martin & Bjerke, Ingvild Elise [Vis alle 11 forfattere av denne artikkelen] (2019). Integrating and analysing heterogeneous rodent neuroscience data using three-dimensional brain reference atlases.
  • Bjerke, Ingvild Elise; Øvsthus, Martin; Andersson, Krister Andreas; Bjaalie, Jan G. & Leergaard, Trygve B. (2018). Best practices for determining and documenting neuroanatomical locations in the rodent brain.
  • Øvsthus, Martin; Bjerke, Ingvild Elise; Yates, Sharon Christine; Bjaalie, Jan G. & Leergaard, Trygve Brauns (2018). Mapping topographical organization in mouse brain subcortical axonal projections using Human Brain Project infrastructure.
  • Blixhavn, Camilla Hagen; Andersson, Krister; Øvsthus, Martin; Bjerke, Ingvild Elise; Kleven, Heidi & Puchades, Maja [Vis alle 8 forfattere av denne artikkelen] (2018). Data integration through digital brain atlasing: Making diverse neuroscience data discoverable using Human Brain Project infrastructure.
  • Leprince, Y; Coello, Sebastian Christopher; Csúcs, Gergely; Chervakov, P; Darine, Dmitri Aleksandrovitsj & Øvsthus, Martin [Vis alle 12 forfattere av denne artikkelen] (2017). Interactive tools for registering of 2D and 3D images to reference atlases.
  • Andersson, Krister Andreas; Bell, Simon; Bjerke, Ingvild Elise; Øvsthus, Martin; Blixhavn, Camilla Hagen & Kleven, Heidi [Vis alle 18 forfattere av denne artikkelen] (2017). Submitting data and metadata through the HBP Data Workbench: Concepts, data flows, policies, and best practices.
  • Bjerke, Ingvild Elise; Andersson, Krister Andreas; Øvsthus, Martin; Puchades, Maja ; Bjaalie, Jan G. & Leergaard, Trygve B. (2017). Navigating the rodent brain: Best practice recommendations for determining and documenting spatial location for neuroscience data .
  • Andersson, Krister; Øvsthus, Martin; Bjerke, Ingvild Elise; Puchades, Maja ; Telefont, Martin & Jeff, Muller [Vis alle 9 forfattere av denne artikkelen] (2017). Data integration through digital brain atlasing: Human Brain Project infrastructure.
  • Bjerke, Ingvild Elise; Andersson, Krister; Øvsthus, Martin; Puchades, Maja ; Bjaalie, Jan G. & Leergaard, Trygve Brauns (2017). Determining and documenting the anatomical location of experimental neuroscience data: Best practice recommendations.
  • Puchades, Maja ; Csúcs, Gergely; Checinska, Martyna; Øvsthus, Martin; Bjerke, Ingvild Elise & Andersson, Krister [Vis alle 8 forfattere av denne artikkelen] (2017). Neuroinformatics tool and workflow for anchoring of serial histological images in rodent brain 3D space.
  • Puchades, Maja ; Øvsthus, Martin; Bjerke, Ingvild Elise; Andersson, Krister; Csúcs, Gergely & Leergaard, Trygve Brauns [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2017). Data integration through digital brain atlasing: semiautomatic spatial registration of serial histological images to rodent brain 3D reference atlases.
  • Puchades, Maja ; Bjerke, Ingvild Elise; Øvsthus, Martin; Andersson, Krister; Csúcs, Gergely & Leergaard, Trygve Brauns [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2016). Spatial registration of serial histological image data to reference brain atlases.
  • Berggaard, Nina; Bjerke, Ingvild Elise; Paulsen, Anna Elisabeth Bråthen & Van der Want, Johannes (2016). Parvalbumin interneurons within a spatially modulating network: development and connectivity.

Se alle arbeider i Cristin

Publisert 2. juni 2022 08:53 - Sist endret 3. okt. 2023 15:28