Jan G. Bjålie

Professor
Bilde av Jan G. Bjålie
English version of this page
Telefon +47-22851263
Mobiltelefon +47-91787901
Rom L-165
Brukernavn
Besøksadresse Domus Medica Gaustad Sognsvannsveien 9 0372 Oslo
Postadresse Avdeling for molekylærmedisin Postboks 1105 Blindern 0317 Oslo

Team Flinstad Harbo stiller til valg

CV - English web pages

Jan Bjålie er utdannet cand.med. ved UiO i 1986. Han ble dr.med. ved Anatomisk institutt i 1990, førsteamanuensis ved Instituttgruppe for medisinske basalfag i 1991 og professor ved samme institutt i 1997. I perioden 2009-2016 var han instituttleder ved Institutt for medisinske basalfag ved Det medisinske fakultet, UiO. Han har hatt en rekke ulike verv og ansvar ved instituttet for både undervisning og forskning og har ledet forskningsgruppe og nevroinformatisk utviklingsarbeid fra 90-tallet. Han har også vært hovedtillitsvalgt for Leger i vitenskapelige stillinger ved UiO og leder av Akademikerne ved UiO. I 2003 gikk hans forskningsgruppe inn i et Senter for fremragende forskning, Center for Molecular Biology and Neuroscience, og i 2016 ble han ansatt ved Karolinska Institutet i Stockholm med ansvar for å bygge opp International Neuroinformatics Coordinating Facility som organisasjonens første leder. I 2017 overtok kan ansvaret for å koordinere nevroinformatikk-delen av Human Brain Project, et av de største forskningsprosjektene som har vært finansiert av EU. Fra 2019 har han vært leder av infrastrukturutviklingen i den Europeiske digitale forskningsinfrastrukturen EBRAINS, som ble tatt opp på ESFRI-veikartet i 2021. Bjålie har også vært leder av International Brain Initiative, som har koordinert samarbeidsaktiviteter mellom store prosjekter i blant annet USA og Japan. 

Emneord: Hjernen og nervesystemet, Nevroinformatikk, Hjernearkitektur, Digitale hjerneatlas, Livsvitenskap

Publikasjoner

  • Schirner, Michael; Domide, Lia; Perdikis, Dionysios; Triebkorn, Paul; Stefanovski, Leon & Pai, Roopa [Vis alle 44 forfattere av denne artikkelen] (2022). Brain simulation as a cloud service: The Virtual Brain on EBRAINS. NeuroImage. ISSN 1053-8119. 251. doi: 10.1016/j.neuroimage.2022.118973.
  • Tocco, Chiara; Øvsthus, Martin; Bjaalie, Jan G.; Leergaard, Trygve B. & Studer, Michèle (2022). The topography of corticopontine projections is controlled by postmitotic expression of the area-mapping gene Nr2f1. Development. ISSN 0950-1991. 149(5). doi: 10.1242/dev.200026. Fulltekst i vitenarkiv
  • Amunts, Katrin; Defelipe, Javier; Pennartz, Cyriel M.A.; Destexhe, Alain; Migliore, Michele & Ryvlin, Philippe [Vis alle 15 forfattere av denne artikkelen] (2022). Linking Brain Structure, Activity, and Cognitive Function through Computation. eNeuro. ISSN 2373-2822. 9(2). doi: 10.1523/ENEURO.0316-21.2022.
  • Eke, Damian Okaibedi; Bernard, Amy; Bjaalie, Jan G.; Chavarriaga, Ricardo; Hanakawa, Takashi & Hannan, Anthony J [Vis alle 13 forfattere av denne artikkelen] (2021). International data governance for neuroscience. Neuron. ISSN 0896-6273. 110. doi: 10.1016/j.neuron.2021.11.017. Fulltekst i vitenarkiv
  • Dojat, Michel; Bjaalie, Jan G. & Barbier, Emmanuel L (2021). Editorial: APPNING: Animal Population Imaging. Frontiers in Neuroinformatics. ISSN 1662-5196. 15, s. 1–3. doi: 10.3389/fninf.2021.676603. Fulltekst i vitenarkiv
  • Royan, Muhammad Rahmad; Siddique, Khadeeja; Csucs, Gergely; Puchades, Maja ; Nourizadeh-Lillabadi, Rasoul & Bjaalie, Jan G. [Vis alle 9 forfattere av denne artikkelen] (2021). 3D Atlas of the Pituitary Gland of the Model Fish Medaka (Oryzias latipes). Frontiers in Endocrinology. ISSN 1664-2392. 12. doi: 10.3389/fendo.2021.719843. Fulltekst i vitenarkiv
  • Abrams, Mathew Birdsall; Bjaalie, Jan G.; Das, Samir; Egan, Gary F.; Ghosh, Satrajit S. & Goscinski, Wojtek J. [Vis alle 23 forfattere av denne artikkelen] (2021). A Standards Organization for Open and FAIR Neuroscience: the International Neuroinformatics Coordinating Facility. Neuroinformatics. ISSN 1539-2791. doi: 10.1007/s12021-020-09509-0. Fulltekst i vitenarkiv
  • Groeneboom, Nicolaas Ervik; Yates, Sharon Christine; Puchades, Maja & Bjaalie, Jan G. (2020). Nutil: A Pre- and Post-processing Toolbox for Histological Rodent Brain Section Images. Frontiers in Neuroinformatics. ISSN 1662-5196. doi: 10.3389/fninf.2020.00037.
  • Bjerke, Ingvild Elise; Yates, Sharon Christine; Laja, Arthur; Witter, Menno; Puchades, Maja & Bjaalie, Jan G. [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2020). Densities and numbers of calbindin and parvalbumin positive neurons across the rat and mouse brain. iScience. ISSN 2589-0042. 24:101906(1), s. 1–52. doi: 10.1016/j.isci.2020.101906. Fulltekst i vitenarkiv
  • Bjerke, Ingvild Elise; Puchades, Maja ; Bjaalie, Jan G. & Leergaard, Trygve B. (2020). Database of literature derived cellular measurements from the murine basal ganglia. Scientific Data. ISSN 2052-4463. 7. doi: 10.6084/m9.figshare.12199088.
  • Adams, Amy; Albin, Stephanie; Amunts, Katrin; Asakawa, Tasia; Bernard, Amy & Bjaalie, Jan G. [Vis alle 41 forfattere av denne artikkelen] (2020). International Brain Initiative: An Innovative Framework for Coordinated Global Brain Research Efforts. Neuron. ISSN 0896-6273. 105(2), s. 212–216. doi: 10.1016/j.neuron.2020.01.002.
  • Aarestrup, FM; Albeyatti, A; Armitage, W; Auffray, C; Augello, L & Balling, Rudi [Vis alle 52 forfattere av denne artikkelen] (2020). Towards a European health research and innovation cloud (HRIC). Genome Medicine. ISSN 1756-994X. 12(18). doi: 10.1186/s13073-020-0713-z. Fulltekst i vitenarkiv
  • Yates, Sharon Christine; Groeneboom, Nicolaas Ervik; Coello, Christopher; Lichtenthaler, Stefan F.; Kuhn, Peer-Hendrik & Demuth, Hans-Ulrich [Vis alle 12 forfattere av denne artikkelen] (2019). QUINT: Workflow for Quantification and Spatial Analysis of Features in Histological Images From Rodent Brain. Frontiers in Neuroinformatics. ISSN 1662-5196. 13. doi: 10.3389/fninf.2019.00075. Fulltekst i vitenarkiv
  • Amunts, Katrin; Knoll, Alois C; Lippert, Thomas; Pennartz, Cyriel M.A.; Ryvlin, Philippe & Destexhe, Alain [Vis alle 9 forfattere av denne artikkelen] (2019). The Human Brain Project?Synergy between neuroscience, computing, informatics, and brain-inspired technologies. PLoS Biology. ISSN 1544-9173. 17(7). doi: 10.1371/journal.pbio.3000344. Fulltekst i vitenarkiv
  • Lillehaug, Sveinung; Yetman, Michael J.; Puchades, Maja ; Checinska, Martyna; Kleven, Heidi & Jankowsky, Joanna L. [Vis alle 8 forfattere av denne artikkelen] (2019). Data Descriptor: Brain-wide distribution of reporter expression in five transgenic tetracyclinetransactivator mouse lines. Scientific Data. ISSN 2052-4463. 6, s. 1–15. doi: 10.1038/sdata.2019.28.
  • Puchades, Maja ; Csúcs, Gergely; Ledergerber, Debora; Leergaard, Trygve B. & Bjaalie, Jan G. (2019). Spatial registration of serial microscopic brain images to three-dimensional reference atlases with the QuickNII tool. PLOS ONE. ISSN 1932-6203. 14(5). doi: 10.1371/journal.pone.0216796. Fulltekst i vitenarkiv
  • Heiland, Tina; Zeitschel, Ulrike; Puchades, Maja ; Kuhn, Peer-Hendrik; Lichtenthaler, Stefan F. & Bjaalie, Jan G. [Vis alle 9 forfattere av denne artikkelen] (2018). Defined astrocytic expression of human amyloid precursor protein in Tg2576 mouse brain. Glia. ISSN 0894-1491. 67(2), s. 393–403. doi: 10.1002/glia.23550. Fulltekst i vitenarkiv
  • Bjerke, Ingvild Elise; Øvsthus, Martin; Andersson, Krister Andreas; Blixhavn, Camilla Hagen; Kleven, Heidi & Yates, Sharon Christine [Vis alle 9 forfattere av denne artikkelen] (2018). Navigating the Murine Brain: Toward Best Practices for Determining and Documenting Neuroanatomical Locations in Experimental Studies. Frontiers in Neuroanatomy. ISSN 1662-5129. 12. doi: 10.3389/fnana.2018.00082. Fulltekst i vitenarkiv
  • Plank, Anne-Christine; Canneva, Fabio; Raber, Kerstin; Urbach, Yvonne K; Dobner, Julia & Puchades, Maja [Vis alle 12 forfattere av denne artikkelen] (2018). Early Alterations in Operant Performance and Prominent Huntingtin Aggregation in a Congenic F344 Rat Line of the Classical CAGn51trunc Model of Huntington Disease. Frontiers in Neuroscience. ISSN 1662-4548. 12. doi: 10.3389/fnins.2018.00011. Fulltekst i vitenarkiv
  • Bjerke, Ingvild Elise; Øvsthus, Martin; Papp, Eszter Agnes; Yates, Sharon Christine; Silvestri, L & Fiorilli, J [Vis alle 11 forfattere av denne artikkelen] (2018). Data integration through brain atlasing: Human Brain Project tools and strategies. European psychiatry. ISSN 0924-9338. 50, s. 70–76. doi: 10.1016/j.eurpsy.2018.02.004. Fulltekst i vitenarkiv
  • Dempsey, Bowen; Le, Sheng; Turner, Anita; Bokiniec, Phil; Ramadas, Radhika & Bjaalie, Jan G. [Vis alle 11 forfattere av denne artikkelen] (2017). Mapping and analysis of the connectome of sympathetic premotor neurons in the rostral ventrolateral medulla of the rat using a volumetric brain atlas. Frontiers in Neural Circuits. ISSN 1662-5110. 11. doi: 10.3389/fncir.2017.00009.
  • Schubert, N; Axer, M; Schober, M; Huynh, A; Huysegoms, M & Palomero-Gallagher, N [Vis alle 11 forfattere av denne artikkelen] (2016). 3D reconstructed cyto-, muscarinic M<sub>2</sub> receptor, and fiber architecture of the rat brain registered to the waxholm space atlas. Frontiers in Neuroanatomy. ISSN 1662-5129. 10(MAY). doi: 10.3389/fnana.2016.00051.
  • Papp, Eszter Agnes; Leergaard, Trygve Brauns; Csúcs, Gergely & Bjaalie, Jan G. (2016). Brain-wide mapping of axonal connections: Workflow for automated detection and spatial analysis of labeling in microscopic sections. Frontiers in Neuroinformatics. ISSN 1662-5196. 10(11). doi: 10.3389/fninf.2016.00011. Fulltekst i vitenarkiv
  • Yetman, Michael J.; Lillehaug, Sveinung; Bjaalie, Jan G.; Leergaard, Trygve Brauns & Jankowsky, Joanna L. (2016). Transgene expression in the Nop-tTA driver line is not inherently restricted to the entorhinal cortex. Brain Structure and Function. ISSN 1863-2653. 221(4), s. 2231–2249. doi: 10.1007/s00429-015-1040-9.
  • Zakiewicz, Izabela Maria; Majka, Piotr; Wòjcik, Daniel K.; Bjaalie, Jan G. & Leergaard, Trygve Brauns (2015). Three-Dimensional Histology Volume Reconstruction of Axonal Tract Tracing Data: Exploring Topographical Organization in Subcortical Projections from Rat Barrel Cortex. PLOS ONE. ISSN 1932-6203. 10(9). doi: 10.1371/journal.pone.0137571.

Se alle arbeider i Cristin

  • Sand, Olav; Sjaastad, Øystein; Haug, Egil & Bjaalie, Jan G. (2021). Människokroppen - Fysiologi och anatomi, 3. upplagan. Liber. ISBN 978-91-47-14287-3. 668 s.
  • Sand, Olav; Sjaastad, Øystein; Haug, Egil & Bjaalie, Jan G. (2019). Anatomi og fysiologi - Menneskekroppen, 4. utgave. Gads forlag. ISBN 9788712058328. 666 s.
  • Sjaastad, Øystein; Toverud, Kari C.; Sand, Olav; Bjaalie, Jan G. & Egil, Haug (2018). Arbeidsbok til Menneskekroppen - Fysiologi og anatomi, 3. utgave. Gyldendal Akademisk. ISBN 978-82-05-51403-4. 224 s.
  • Sand, Olav; Sjaastad, Øystein; Haug, Egil & Bjaalie, Jan G. (2018). Menneskekroppen - Fysiologi og anatomi, 3. utgave. Gyldendal Akademisk. ISBN 978-82-05-50482-0. 666 s.
  • Sand, Olav; Sjaastad, Øystein; Haug, Egil & Bjaalie, Jan G. (2015). Menneskets anatomi og fysiologi 3. utgave. Gads Forlag. ISBN 978-87-12-05107-7. 538 s.
  • Sjaastad, Øystein; Toverud, Kari C.; Sand, Olav; Bjaalie, Jan G. & Egil, Haug (2015). Studieoppgaver til Menneskets anatomi og fysiologi. Gads forlag. ISBN 9788712050353. 203 s.

Se alle arbeider i Cristin

  • van Swieten, Maaike; Schmid, Oliver; Dénervaud, Gilles; Tsanaktsidis, Ioannis; Weyers, Benjamin & Davison, Andrew P. [Vis alle 9 forfattere av denne artikkelen] (2022). A Practical Guide to Using the EBRAINS Knowledge Graph in (your) Research.
  • van Swieten, Maaike & Bjaalie, Jan G. (2021). How to make data public.
  • Abrams, Mathew Birdsall; Bjaalie, Jan G.; Das, Samir; Egan, Gary F.; Ghosh, Satrajit S. & Goscinski, Wojtek J. [Vis alle 23 forfattere av denne artikkelen] (2021). Correction to: A Standards Organization for Open and FAIR Neuroscience: the International Neuroinformatics Coordinating Facility (Neuroinformatics, (2021), 10.1007/s12021-020-09509-0). Neuroinformatics. ISSN 1539-2791. doi: 10.1007/s12021-021-09522-x.
  • Quaglio, GianLuca; Toia, Patrizia; Moser, Edvard Ingjald; Karapiperis, Theodoros; Amunts, Katrin & Okabe, Shigeo [Vis alle 12 forfattere av denne artikkelen] (2021). The International Brain Initiative: enabling collaborative science. Lancet Neurology. ISSN 1474-4422. 20(12), s. 985–986. doi: 10.1016/S1474-4422%2821%2900389-6.
  • Reiten, Ingrid; Schlegel, Ulrike; Aasebø, Ida; Zehl, Lyuba; Blixhavn, Camilla Hagen & Davison, Andrew [Vis alle 17 forfattere av denne artikkelen] (2021). Data sharing via EBRAINS: why and how .
  • Bjaalie, Jan G. (2021). SESSION IV: Value and costs of managing and sharing Data: Reflections from the field and panel Discussion.
  • Bjaalie, Jan G. (2021). Chair session 9 and Talk: Introduction to the International Brain Initiative.
  • Bjaalie, Jan G. (2021). Chair session 11:"Towards neuroscience-centered selection criteria for data repositories and scientific gateways".
  • Bjaalie, Jan G. (2021). Presentation Session 6: Tools and infrastructure showcase: EBRAINS.
  • Bjaalie, Jan G. (2021). Chair at Parallel sessions at FLAG-ERA Project Workshop.
  • Bjaalie, Jan G. (2021). Talk: "Reproducible and transparent neuroscience: EBRAINS services for publishing research data" .
  • Bjaalie, Jan G. (2021). Panel 255: A Canadian BRAIN initiative?
  • Schlegel, Ulrike; Köhnen, Stefan; Davison, Andrew P.; Najafi, Peyman; Weyers, Benjamin & Gründling, Jan [Vis alle 17 forfattere av denne artikkelen] (2021). openMINDS - flexible metadata models for neuroscience.
  • Puchades, Maja ; Yates, Sharon Christine; Bjerke, Ingvild Elise; Groeneboom, Nicolaas; Csucs, Gergely & Leergaard, Trygve B. [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2021). Implementing the QUINT workflow for spatial quantitative analysis of labelling in mice and rats.
  • Bjaalie, Jan G. (2020). Global Neuroethic Summit Cross IBI workshop.
  • Bjaalie, Jan G. (2020). EBRA-EPICLUSTER Consensus Workshop. Overview Human Brain Project and General view on research infrastructures and research clusters. .
  • Bjaalie, Jan G. (2020). Presentation: Overview of Human Brain Project at 6th Internation Brain Intitiative Investigators Meeting .
  • Bjaalie, Jan G. (2020). Introduction to EBRAINS at Code Jam # 11.
  • Yates, Sharon Christine; Groeneboom, Nicolaas; Csucs, Gergely; Leergaard, Trygve B.; Kreshuk, Anna & Kutra, Dominik [Vis alle 8 forfattere av denne artikkelen] (2020). New functionalities i the QUINT workflow for brain atlas based image analysis.
  • Einevoll, Gaute; Bjaalie, Jan G. & Plesser, Hans Ekkehard (2020). Om hjerneforskning og Human Brain Project . [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
  • Gurdon, Brianna; Hadad, Niran; Telpoukhovskaia, Maria; Yates, Sharon Christine; Puchades, Maja & Bjaalie, Jan G. [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2020). Brain-wide spatial analysis to identify region-specific changes in cell composition associated with resilience to Alzheimer’s disease in the AD-BXD mouse population.
  • Reiten, Ingrid; Schlegel, Ulrike; Aasebø, Ida Elisabeth Jørgensen; Blixhavn, Camilla Hagen; Zehl, Lyuba & Kjelsberg, Kasper [Vis alle 13 forfattere av denne artikkelen] (2020). Neuroscience community-gains from data sharing through the EBRAINS infrastructure.
  • Schlegel, Ulrike; Reiten, Ingrid; Aasebø, Ida Elisabeth Jørgensen; Blixhavn, Camilla Hagen; Zehl, Lyuba & Kjelsberg, Kasper [Vis alle 13 forfattere av denne artikkelen] (2020). EBRAINS data sharing: benefits and workflow.
  • Reiten, Ingrid; Schlegel, Ulrike; Blixhavn, Camilla Hagen; Andersson, Krister Andreas; Aasebø, Ida Elisabeth Jørgensen & Yates, Sharon Christine [Vis alle 12 forfattere av denne artikkelen] (2020). Data sharing through the online EBRAINS platform: a new service for brain research.
  • Bjaalie, Jan G. (2020). International Brain Initiative: Facilitating Global Neuroscience Engagement.
  • Bjaalie, Jan G. (2020). Sharing and publishing human brain data through the EBRAINS research infrastructure (GDPR impact conference).
  • Andersson, Krister Andreas; Blixhavn, Camilla Hagen; Zehl, Lyuba; Zarfarnia, Sara; Köhnen, Stefan & Hilverling, Anna [Vis alle 19 forfattere av denne artikkelen] (2019). Resources for making neuroscience data FAIR. The Human Brain Project invites researchers to share, find, and use data via the new EBRAINS infrastructure.
  • Andersson, Krister Andreas; Blixhavn, Camilla Hagen; Kleven, Heidi; Zehl, Lyuba; Bjerke, Ingvild Elise & Schmid, Oliver [Vis alle 17 forfattere av denne artikkelen] (2019). Neuroinformatics platform for making neuroscience data Findable, Accessible, Interoperable, and Reuseable.
  • Andersson, Krister Andreas; Blixhavn, Camilla Hagen; Kleven, Heidi; Schlegel, Ulrike; Oliver, Schmid & Puchades, Maja [Vis alle 10 forfattere av denne artikkelen] (2019). EBRAINS fair data service: A novel infrastructure for making neuroscience data findable, accessible, interoperable, and reuseable.
  • Puchades, Maja ; Yates, Sharon Christine; Groeneboom, Nicolaas; Csúcs, Gergely; Leergaard, Trygve B. & Bjaalie, Jan G. (2019). Workflow for quantification and spatial analysis of labeling in large series of histological images from murine brains.
  • Blixhavn, Camilla Hagen; Andersson, Krister Andreas; Kleven, Heidi; Schlegel, Ulrike; Puchades, Maja & Bjaalie, Jan G. [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2019). Find and explore rodent brain data using 3D atlases in the new EBRAINS infrastructure.
  • Yates, Sharon Christine; Groeneboom, Nicolaas; Csúcs, Gergely; Leergaard, Trygve B.; Puchades, Maja & Bjaalie, Jan G. (2019). Batch quantification and spatial analysis of labelling in microscopic rodent brain sections .
  • Blixhavn, Camilla Hagen; Andersson, Krister Andreas; Kleven, Heidi; Schlegel, Ulrike; Puchades, Maja & Bjaalie, Jan G. [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2019). Infrastructure and workflow for integrating and navigating multi-scale and multi-modal murine neuroscience data using 3D digital brain reference atlases.
  • Schlegel, Ulrike; Blixhavn, Camilla Hagen; Andersson, Krister Andreas; Yates, Sharon Christine; Øvsthus, Martin & Bjerke, Ingvild Elise [Vis alle 11 forfattere av denne artikkelen] (2019). Integrating and analysing heterogeneous rodent neuroscience data using three-dimensional brain reference atlases.
  • Andersson, Krister Andreas; Blixhavn, Camilla Hagen; Zehl, Lyuba; Markovic, Milica; Kleven, Heidi & Zafarnia, Sara [Vis alle 15 forfattere av denne artikkelen] (2018). HBP Curation service: Share your data via the Neuroinformatics platform.
  • Zehl, Lyuba; Zafarnia, Sara; Köhnen, Stefan; Andersson, Krister Andreas; Markovic, Milica & Legouée, Elodie [Vis alle 20 forfattere av denne artikkelen] (2018). Integrating neuroscientific data into a unified database: from individual experiments to a standardized metadata collection using the Human Brain Project Neuroinformatics Platform.
  • Zehl, Lyuba; Zafarnia, Sara; Köhnen, Stefan; Andersson, Krister Andreas; Markovic, Milica & Legouée, Elodie [Vis alle 20 forfattere av denne artikkelen] (2018). Integrating neuroscientific data into a unified database: from individual experiments to a standardized metadata collection using the Human Brain Project Neuroinformatics Platform.
  • Yates, Sharon Christine; Puchades, Maja ; kreshuk, anna; Kutra, Dominik; Leergaard, Trygve B. & Bjaalie, Jan G. [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2018). HBP Analytic Workflow: from Microscopic Image Data to Extracted Features in Atlas Space.
  • Bjaalie, Jan G. (2018). Data sharing in neuroscience: traditions, standards, and transformations.
  • von Linstow, Christian Ulrich; Yates, Sharon Christine; Leergaard, Trygve B.; Plank, A-C; von Hörsten, S. & Puchades, Maja [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2018). Whole brain analysis of Huntingtin aggregates in the F344 transgenic rat model of Huntington’s disease.
  • Bjerke, Ingvild Elise; Øvsthus, Martin; Andersson, Krister Andreas; Bjaalie, Jan G. & Leergaard, Trygve B. (2018). Best practices for determining and documenting neuroanatomical locations in the rodent brain.
  • Øvsthus, Martin; Bjerke, Ingvild Elise; Yates, Sharon Christine; Bjaalie, Jan G. & Leergaard, Trygve Brauns (2018). Mapping topographical organization in mouse brain subcortical axonal projections using Human Brain Project infrastructure.
  • Blixhavn, Camilla Hagen; Andersson, Krister; Øvsthus, Martin; Bjerke, Ingvild Elise; Kleven, Heidi & Puchades, Maja [Vis alle 8 forfattere av denne artikkelen] (2018). Data integration through digital brain atlasing: Making diverse neuroscience data discoverable using Human Brain Project infrastructure.
  • Leprince, Y; Coello, Sebastian Christopher; Csúcs, Gergely; Chervakov, P; Darine, Dmitri Aleksandrovitsj & Øvsthus, Martin [Vis alle 12 forfattere av denne artikkelen] (2017). Interactive tools for registering of 2D and 3D images to reference atlases.
  • Imad, Jala; Kleven, Heidi; Clascá, Francisco; Wennberg, Arvind Eirik; Osen, Kirsten Kjelsberg & Coello, Sebastian Christopher [Vis alle 11 forfattere av denne artikkelen] (2017). Enriching and adding detail to the Waxholm Space rat brain reference atlas.
  • Andersson, Krister Andreas; Bell, Simon; Bjerke, Ingvild Elise; Øvsthus, Martin; Blixhavn, Camilla Hagen & Kleven, Heidi [Vis alle 18 forfattere av denne artikkelen] (2017). Submitting data and metadata through the HBP Data Workbench: Concepts, data flows, policies, and best practices.
  • Coello, Sebastian Christopher; Leergaard, Trygve B. & Bjaalie, Jan G. (2017). Tackling the normalization of 2-D rodent histology sections in a 3-D coordinate space.
  • Coello, Sebastian Christopher; Leergaard, Trygve B. & Bjaalie, Jan G. (2017). Tackling the normalization of 2-D rodent histology sections in a 3-D coordinate space.
  • Bjerke, Ingvild Elise; Andersson, Krister Andreas; Øvsthus, Martin; Puchades, Maja ; Bjaalie, Jan G. & Leergaard, Trygve B. (2017). Navigating the rodent brain: Best practice recommendations for determining and documenting spatial location for neuroscience data .
  • Imad, Jala; Osen, Kirsten Kjelsberg; Clascá, Francisco; Wennberg, Arvind E.; Coello, Sebastian Christopher & Csúcs, Gergely [Vis alle 9 forfattere av denne artikkelen] (2017). Enriching and Adding Detail to the Waxholm Space Rat Brain Reference Atlas.
  • Yates, Sharon Christine; Puchades, Maja ; Coello, Sebastian Christopher; Kreshuk, Anna; Hartlage-Rübsamen, Maike & Rossner, Steffen [Vis alle 8 forfattere av denne artikkelen] (2017). Workflow for automated quantification and spatial analysis of labelling in microscoping rodent brain sections.
  • Andersson, Krister; Øvsthus, Martin; Bjerke, Ingvild Elise; Puchades, Maja ; Telefont, Martin & Jeff, Muller [Vis alle 9 forfattere av denne artikkelen] (2017). Data integration through digital brain atlasing: Human Brain Project infrastructure.
  • Bjerke, Ingvild Elise; Andersson, Krister; Øvsthus, Martin; Puchades, Maja ; Bjaalie, Jan G. & Leergaard, Trygve Brauns (2017). Determining and documenting the anatomical location of experimental neuroscience data: Best practice recommendations.
  • Yates, Sharon Christine; Puchades, Maja ; Coello, Sebastian Christopher; Kreshuk, Anna; Hartlage-Rübsamen, Maike & Rossner, Steffen [Vis alle 8 forfattere av denne artikkelen] (2017). Workflow for automated quantification and spatial analysis of labeling in microscoping rodent brain sections.
  • Puchades, Maja ; Csúcs, Gergely; Checinska, Martyna; Øvsthus, Martin; Bjerke, Ingvild Elise & Andersson, Krister [Vis alle 8 forfattere av denne artikkelen] (2017). Neuroinformatics tool and workflow for anchoring of serial histological images in rodent brain 3D space.
  • Puchades, Maja ; Øvsthus, Martin; Bjerke, Ingvild Elise; Andersson, Krister; Csúcs, Gergely & Leergaard, Trygve Brauns [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2017). Data integration through digital brain atlasing: semiautomatic spatial registration of serial histological images to rodent brain 3D reference atlases.
  • Bjaalie, Jan G. (2017). Infrastructure for digital brain atlasing: storing, organizing, visualizing and analyzing large quantities of heterogeneous neuroscience research data.
  • Puchades, Maja ; Bjerke, Ingvild Elise; Øvsthus, Martin; Andersson, Krister; Csúcs, Gergely & Leergaard, Trygve Brauns [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2016). Spatial registration of serial histological image data to reference brain atlases.
  • Puchades, Maja Amedjkouh; Darine, Dmitri Aleksandrovitsj; Csúcs, Gergely; Lillehaug, Sveinung; Leergaard, Trygve Brauns & Bjaalie, Jan G. (2015). Feeding rodent brain data to computational models through HBP spatial atlas templates and knowledge graph portal.
  • Schubert, N; Axer, M; Graessel, D; Schober, M; Huynh, A & Huysegoms, M [Vis alle 11 forfattere av denne artikkelen] (2015). 3D reconstructed fiber-, cyto- and receptorarchitecture of the rat brain transferred into the Waxholm Space atlas.
  • Bjaalie, Jan G. (2015). Mouse and rat brain atlasing: tools and templates for web-­‐enabled data integration.
  • Bjaalie, Jan G. (2015). Brain atlasing: rodent to human.
  • Bjaalie, Jan G. (2015). Global collaborative brain research: the International Neuroinformatics Coordinating Facility.
  • Bjaalie, Jan G. (2015). Brain atlasing and the role of the International Neuroinformatics Coordinating Facility (INCF) in global neuroscience research .
  • Papp, Eszter Agnes; Bjaalie, Jan G. & Leergaard, Trygve Brauns (2018). MR-basert atlas av rottehjernen for integrasjon av bildedata. Faculty of Medicine, University of Oslo. ISSN 978-82-8377-194-7. Fulltekst i vitenarkiv

Se alle arbeider i Cristin

Publisert 13. apr. 2011 10:35 - Sist endret 18. aug. 2022 08:51

Forskergrupper