Precision-MAID – Presisjonsmedisin assistert av kunstig intelligens i inflammatorisk tarmsykdom

Vi bruker gensekvensering for å kartlegge bakterieflora hos pasienter med inflammatorisk tarmsykdom sammenlignet med friske personer for å undersøke om bakterieflora kan brukes som markører for type og alvorlighetsgrad av sykdom.

Om prosjektet

Inflammatorisk tarmsykdom (IBD) er en sykdom forårsaket av betennelse i mage-tarmkanalen som igjen forstyrrer og endrer det normale miljøet som støtter en sunn tarmflora.

Sekvensering av mikrobiota

Ved å bruke genetiske sekvenseringsmetoder på avføringsprøver fra pasienter som deltar i IBSEN III-studien, kan vi undersøke hvilke bakterier de som har fått diagnosen IBD i sitt tarmsystem. Vi vet fra tidligere studier at tarmflora ved IBD kan være forskjellig fra friske mennesker.


Vi finner tydelige forskjeller i tarmflora mellom subtypene av IBD, ulcerøs kolitt og Crohns sykdom, noe som peker mot et diagnostisk potensial for tarmflora.

Vurdere sykdomsforløp

Interessant nok, og på grunn av at pasientene i IBSEN III er ny-diagnostiserte og en uselektert pasientgruppe kan vi nå undersøke hvilket potensiale tarmflora kan ha for å forutsi fremtidige sykdomskomplikasjoner og risiko for sykehusinnleggelse på grunn av alvorlig IBD-sykdom.

Indikasjoner for forskningen

Foreløpige resultater indikerer at pasientenes tarmflora–profil gjør det bedre enn etablerte markører som CRP og kalprotektin når det gjelder å forutsi en alvorlig sykdomsutvikling i IBD.

De som var i ferd med å utvikle alvorlig IBD hadde et lavere antall bakteriearter, og en unik sammensetning av bakterier med økte mengder av blant annet Romboutsia, Veillonella og Streptococcus i sin avføring.

Denne sammensetningen kan betraktes som et «fingeravtrykk» for kommende alvorlig sykdom, og ved hjelp av maskinlæring fant vi at dette fingeravtrykket kunne brukes til å tidlig identifisere pasienter som var i ferd med å utvikle alvorlig IBD – selv om deres CRP og kalprotektin-nivåer virket normale. 

 

Publisert 26. feb. 2024 16:01 - Sist endret 26. feb. 2024 16:01