English version of this page

Xuan Thang Nguyen

Bilde av Xuan Thang Nguyen
Rom 2264
Brukernavn
Besøksadresse Sognsvannsveien 9 Domus Medica 0372 Oslo

Academic interests

Jeg er lidenskapelig opptatt av å studere epigenetikk, spesielt hvordan det påvirker genuttrykk i kreft og utviklingsbiologi, der unormal regulering kan føre til endringer i celleprogrammering. Jeg er ivrig etter å kombinere våtlab- og bioinformatikkmetoder for å utforske multiomikk og forstå reguleringen av epigenomet – ved bruk av WGS med både korte og lange sekvenseringslesninger, transkripsjonsfaktoranalyse, RNA-seq, ChIP-seq, ATAC-seq og Hi-C-sekvensering. Jeg er også interessert i å undersøke hvordan mutasjoner i transkripsjonsfaktorer og unormale epigenetiske profiler kan bidra til utvikling av kreft, ved hjelp av avanserte NGS-teknikker.

Background

Under mastergraden min fokuserte jeg på INO80-kromatinremodelleren og dens regulering av østrogenreseptor (ER)-aktivitet i brystkreftmodeller. Forskningen min viste samarbeidet og de fysiske interaksjonene mellom INO80 og ER, som muliggjorde dynamisk ER-regulering i genuttrykk gjennom RNA-sekvensering, ChIP-seq og gen-nedreguleringsteknikker i luminale brystkreftcellelinjer. For tiden jobber jeg med sarkomcellelinjer, der de fleste viser en kompleks genomisk struktur og regulering av epigenetiske avvik. Ved hjelp av multiomikk-tilnærminger ønsker jeg å undersøke hvordan samspillet mellom genomiske og epigenetiske avvik driver høy aggressivitet i osteosarkom, liposarkom og rhabdomyosarkom.

 

Emneord: Epigenetics, Cancer epigenetics, Bioinformatics

Publikasjoner

1. Yoo, H.; La, H.; Lee, E.J.; Choi, H.-J.; Oh, J.; Thang, N.X.; Hong, K. ATP-Dependent Chromatin Remodeler CHD9 Controls the Proliferation of Embryonic Stem Cells in a Cell Culture Condition-Dependent Manner. Biology 2020, 9, 428. https://doi.org/10.3390/biology9120428

2. Thang, N.X.; Yoo, S.; La, H.; Lee, H.; Park, C.; Park, K.S.; Hong, K. Epigenetic Factors as Etiological Agents, Diagnostic Markers, and Therapeutic Targets for Luminal Breast Cancer. Biomedicines 2022, 10, 748. https://doi.org/10.3390/biomedicines10040748

3. Yoo S, Lee EJ, Thang NX, La H, Lee H, Park C, Han DW, Uhm SJ, Song H, Do JT, Choi Y, Hong K. INO80 Is Required for the Cell Cycle Control, Survival, and Differentiation of Mouse ESCs by Transcriptional Regulation. International Journal of Molecular Sciences. 2022; 23(23):15402. https://doi.org/10.3390/ijms232315402

4. Thang NX, Han DW, Park C, Lee H, La H, Yoo S, Lee H, Uhm SJ, Song H, Do JT, Park KS, Choi Y, Hong K. INO80 function is required for mouse mammary gland development, but mutation alone may be insufficient for breast cancer. Front Cell Dev Biol. 2023 Nov 1;11:1253274. doi: 10.3389/fcell.2023.1253274. PMID: 38020889; PMCID: PMC10646318.

  • Nguyen, Xuan Thang; Martiensen, Emily Louise Beecher; Abdelhalim, Mohamed; Tran, Trung; Ledsaak, Marit & Rogne, Marie [Vis alle 8 forfattere av denne artikkelen] (2026). Proteome-wide multi-omics profiling of osteosarcoma transcription factor networks. bioRxiv (preprint article). doi: 10.64898/2026.03.29.714917. Fulltekst i vitenarkiv

Se alle arbeider i NVA

Publisert 21. nov. 2024 09:54 - Sist endret 21. nov. 2024 09:54