Prefix for stammer (Pedigree prefix)
Ved registrering av genmodifiserte og andre dyr skal prefix gi tydelig informasjon om stammen og de berørte genene:
- Genmodifiserte dyr: Prefix skal inneholde informasjon om genet som er påvirket.
- Viktig: Unngå å bruke samlebetegnelser som tg, ko eller fl i selve prefixet.
- Andre dyr: Prefix bør inneholde den relevante delen av stammenavnet.
- Kommersielle villtyper: Ville typer kjøpt fra kommersielle leverandører skal føres opp med sitt komplette stammenavn.
Stammenavnet må enten være en korrekt representasjon i henhold til nomenklaturreglene, eller et korrekt navn for bakgrunnen til den genetiske modifikasjonen. Dette er ekstra viktig for forskningsgrupper som benytter samme modifikasjon på mer enn én bakgrunn.
Merk: Oppgaver eller bestillinger som ikke kan utføres i henhold til disse spesifikasjonene, vil bli merket med svart av de ansatte ved KM.
Retningslinjer for genotyper
Feltet for genotype er beregnet på å beskrive ett enkelt locus.
Standard forkortelser
Bruk følgende forkortelser i feltet for genotype:
- tg: Tilstedeværelse av transgenet angitt i prefixet
- ko: Knockout-allel
- fl: Floxed allel
- ki: Knock-in allel
- wt: Unmodifiserte loci (villtype)
- x / y: Kan brukes i stedet for wt for å klargjøre arvegang ved X- og Y-koblede modifikasjoner
- ?: Brukes der genotypingsprotokollen ikke kan skille homozygot fra hemi-/heterozygot
Unngå pluss og minus: Du må aldri bruke + eller -, da disse lett misforstås.
Eksempler på enkle genotyper
ko/ko
tg/?
fl/wt
Flere genetiske modifikasjoner
Dersom dyret har to genetiske modifikasjoner, gjelder følgende:
- Begge modifikasjonene skal fremgå av stammenavnet.
- Genotypene skal adskilles med et semikolon ; mellom allelparene.
Eksempel: ko/ko;tg/x
Spesielle regler for Barriereenheten
Barriereenheten skal ivareta og trygge unike stammelinjer. For at de ansatte skal kunne drifte enheten effektivt, gjelder følgende rutiner:
- Bursammensetning: De ansatte vil holde inntil to avlsbur for hver genetiske modifikasjon, samt to reservebur med dyr med definerte genotyper.
- Flytting av dyr: Så snart minst ett av avlsburene produserer avkom, overføres alle øvrige bur til MDU.
- Forespørsel om venting: Dersom du ønsker å beholde et kull for fremtidig avl, må du be om at det spesifikke kullet blir stående i barrieren i påvente av genotyping.
Ønsker du avvik fra disse konvensjonene? Ta kontakt med de ansatte ved KM for å avtale et møte.
Kontakt og verktøy
Ansvarlig enhet: Komparativ medisin
Relaterte verktøy: FOTS | Science Linker