Tverrfaglig konsortium
NextRNA er et tverrfaglig konsortium finansiert av UiO som samler CRESCO, Senter for embryologi og Institutt for Biovitenskap (IBV) ved UiO for å utvikle neste generasjons RNA‑profilering.
Utgangspunktet er at RNA ikke bare bærer genetisk informasjon, men også et «skjult lag» av signaler – struktur, kjemiske modifikasjoner og interaksjoner – som styrer om RNA skal oversettes, lagres, brytes ned eller transporteres i cellen. Ved å kombinere enkelmolekyl‑ og enkeltcelle‑sekvensering, samt direktesekvensering med nanopore‑teknologi vil vi lese hele repertoaret av RNA‑signaler.
Metoder for bedre forståelse
I laboratoriet utvikler vi metoder som samtidig fanger RNA‑sekvens, isoformer, struktur og modifikasjoner og kobler dette til RNA‑skjebne som oversettelse til protein, stabilitet og transport. Metodene optimaliseres i modellsystemer som zebrafisk, hjerneorganoider og kreftmodeller før de tas i bruk på krevende kliniske prøver som embryoer, kulturmedium og pasientbiopsier, samt i naturforvaltning der RNA‑profilering i ville dyrepopulasjoner kombineres med miljøprøver.
Målet er en robust, standardiserbar og kostnadseffektiv RNA‑plattform som legger grunnlaget for ikke‑invasiv vurdering av embryo ved assistert befruktning, mer presis kreftsubtyping, dypere mekanistisk forståelse av nevrodegenerative sykdommer og nye verktøy for å overvåke helse, stress, tilpasning og reproduksjon hos truede arter i møte med forurensning, høsting og klimaendringer.
Langsiktige mål
Vårt mål er å utvikle neste generasjons RNA‑profilering som en kraftfull ny plattform for grunnforskning. Vi ønsker å muliggjøre ikke‑invasiv vurdering av embryo, høyoppløselig kreftsubtyping, mekanistisk profilering av nevrologiske sykdommer og bevaringsgenomikk.
