Avdeling for Klinisk molekylærbiologi

EpiGen utfører basal- og translasjonsforskning gjennom sin akademiske stab.

Det overordnede målet for vår forskning er å fremme kunnskap om det kliniske molekylære grunnlaget for komplekse sivilisasjonssykdommer med fokus på sunn aldring og forbedret livskvalitet for pasienter.

I tillegg yter EpiGen service, infrastruktur og støtte til klinikere ved Akershus universitetssykehus (Ahus) og andre forskere i HelseSørØst-regionen for å utføre translasjonsforskning av høy kvalitet.

Forskningsmiljøet ved EpiGen er tverrfaglig og består av forskere, klinikere, studiesykepleiere, teknikere, PhD-stipendiater og postdoktorer.

Du kan lese mer om EpiGen og forskningen vi driver med her (ekstern hjemmeside på engelsk): EpiGen (wordpress.com)

Prosjekter

Pågående prosjekter ved EpiGen:

• Aldring og molekylære mekanismer for mitofagi – Prosjektleder førsteamanuensis Fei Fang

• Overvekt og metabolsk syndrom - Prosjektleder professor Yvonne Böttcher

• Kreft - Prosjektleder professor Anita Göndör

• Bruk av avanserte matematiske metoder for å løse problemer innen kreftbiologi – Prosjektleder forsker Junbai Wang

Nylig avsluttede prosjekter:

• DNA reparasjon/Genomstabilitet
• Kreftgenomvariasjon

Eksterne forskningsgrupper som benytter EpiGen-laboratoriene:

• Brystkreft

• Avansert tarmkreft (CMOR)

• Gastromedisin (IBSEN)

• Kardiovaskulær forskningsgruppe (CRG) 

• Klinisk nevrofaglig forskningsgruppe (CNG)

• Mikrobiologi og infeksjonsmedisin

• Ortopedisk forskergruppe

• Pediatrisk forskergruppe (PAEDIA)

Hvordan kan vi hjelpe deg:

Forskningslaboratoriet ved EpiGen har utstyr og personell med lang erfaring i en rekke molekylærbiologiske metoder.

Vi tilbyr utstyr som kan benyttes til å svare på et bredt spekter av biomedisinske og assistanse på prosjekter i samarbeid med prosjektledere.  Se liste over utstyr og teknikker.

Stamcelle-fasilitet

Ahus stamcelle-fasilitet (ASCF) er fysisk lokalisert ved EpiGen og ledes av forsker Kulbhushan Sharma. Fasiliteten tilbyr tjenester til forskning innen stamcellebiologi.
Se liste over europeiske stamcelle-fasiliteter her. 

Vi har ekspertise i å generere pasientspesifikke induserte pluripotente celler (iPSCs) for sykdomsmodellering og potensielle terapier, samt differensiere IPSCs og embryonale stamceller (ESCs) til spesialiserte cellulære linjer (f.eks. forskjellige typer nevroner, mikroglia, monocytter, makrofager, hepatocytter, kardiomyocytter, retinalt pigmentepitel etc.).

Vi tilbyr også svært effektive, fullstendige genomredigeringstjenester (knock-in, knock-out, SNP-korreksjon, reportergenerering osv.) ved hjelp av CRISPR-teknologi på samarbeidsbasis. 

Vi er aktive deltakere i to COST-programmer relatert til genomredigering:

1. CorEuStem, CA20140  og
2. GenE-HumDi, CA21113

Vi kan bistå med forsøksplanlegging/design, gi teknisk støtte og konsultasjon til forskere og klinikere ved Ahus samt eksterne brukere etter avtale.

Stamcelle-fasilitet tilbyr:

• Pasient fibroblast ekspansjon
• Reprogrammering for generering av iPSC-er ved bruk av integrasjonsfrie metoder og deres karakterisering
• Differensiering av iPSCs/ESCs til spesialiserte celletyper ved bruk av egenutviklede differensieringsprotokoller for sykdomsmodellering og medikamentscreening
• Genomredigering av menneskelige iPSC-celler (CRISPR-Cas based)

Trenger du hjelp eller ønsker å utforske samarbeidsmuligheter i de nevnte forskningsområdene, kan du gjerne kontakte leder av Stamcellefasiliteteten Kulbhushan Sharma

kulbhushan.sharma@medisin.uio.no / kulbhushan.sharma@ahus.no

Enhet for presisjonsmedisin

Hva er presisjonsmedisin?

"[…] en betegnelse på et sett med diagnostiske metoder som i større grad enn tradisjonell medisin søker å finne behandling eller forebygging som er tilpasset den enkeltes (i hovedsak genetiske) egenskaper". Kilde: Store Medisinsk Leksikon

Hvorfor presisjonsmedisin?

Vi anser at presisjonsdiagnostikk og etterfølgende persontilpasset behandling kan bedre pasienters helse og velvære gjennom å øke mulighetene til deltakelse i studier. 

Vårt mål

Vi har bred kompetanse innen panelsekvensering, inklusive relevante metoder innen bioinformatikk og molekylærbiologi, slik at vi kan finne genomiske forandringer og sette disse inn i en biologisk/medisinsk kontekst. 
Vår kompetanse brukes i forskjellige kliniske studier (for eksempel PALM-studien (ekstern lenke) og METIMMOX-studien (ekstern lenke)) likt som i det nasjonale samarbeidet InPreD/InPreD Ahus.   

Vi driver også utviklingsarbeid der vi tar i bruk nye metoder innen presisjonsmedisin.

Noen eksempler er:

• Analyse av mutasjonssignaturer i kreft. 
• Funksjonell test for homolog reparasjonskapasitet ved dobbelt trådbrudd
• Kinaseaktivitetprofilering

Laboratoriene ved EpiGen er del av Ahus noden av InPreD (InPreD-Ahus).

Forskning

Planlegger du en studie som kan ha nytte av genetisk presisjonsdiagnostikk? Vi kan hjelpe til med analyser spesielt tilpasset til dit prosjekt.

Ta kontakt – jo tidligere i planlegging jo bedre!

Kontaktinfo:
Koordinator:  Anna Berit Wennerström 
Enhetsleder: Diana Lilian Bordin