Laboratoriet utvikler digitale hjerneatlas og bruker avanserte bildedannende teknikker. NeSys deltar i ledergruppen for den europeiske forskningsinfrastrukturen EBRAINS med ansvar for bidrag til tjenester knyttet til "Data and Knowledge" og "Brain atlas".
Les mer på de engelske sidene til laboratorium for nevrale systemer og prosjektsidene for UiOs bidrag til EBRAINS.
Publikasjoner
- Kleven H, Bjerke IE, Clascá F, Groenewegen HJ, Bjaalie JG, Leergaard TB. Waxholm Space atlas of the rat brain: a 3D atlas supporting data analysis and integration. Nat Methods. 2023. doi: 10.1038/s41592-023-02034-3.
- Carey H, Pegios M, Martin L, Saleeba C, Turner AJ, Everett NA, Bjerke IE, Puchades MA, Bjaalie JG, McMullan S. DeepSlice: rapid fully automatic registration of mouse brain imaging to a volumetric atlas. Nat Commun. 2023. doi: 10.1038/s41467-023-41645-4.
- Kleven H, Gillespie T, Zehl L, Dickscheid T, Bjaalie T, Martone M, Leergaard T. AtOM, an ontology model to standardize use of brain atlases in tools, workflows, and data infrastructures. Scientific Data. 2023. doi: 10.1038/s41597-023-02389-4
- Leergaard TB, Bjaalie JG. Atlas-based data integration for mapping the connections and architecture of the brain. Science. 2022. doi: 10.1126/science.abq2594.
- Yates SC, Groeneboom NE, Coello C, Lichtenthaler SF, Kuhn PH, Demuth HU, Hartlage-Rübsamen M, Roßner S, Leergaard T, Kreshuk A, Puchades MA, Bjaalie JG. QUINT: Workflow for Quantification and Spatial Analysis of Features in Histological Images From Rodent Brain. Front Neuroinform. 2019. doi: 10.3389/fninf.2019.00075.
Finansiering
European Union's Horizon 2020 Framework Programme for Research and Innovation
- EBRAINS Prep
- EBRAINS Health
- SciLake
- EBRAINS 2.0
Forskningsrådet
- INCF Norwegian Node
Universitetet i Oslo
- NORBRAIN
- SHAREbrain
UNIFOR Frimed
