Som fag og forskningsområde har farmakologien sterk forankring både i basale biomedisinske fag og i klinisk medisin. Farmakologi er derfor et sammensatt og mangeartet fagfelt. Men fellesnevneren ligger i målsettingen: å skape innsikt som danner et rasjonelt grunnlag for god medikamentell terapi.
Toksikologien, som omhandler skadelige effekter av kjemiske stoffer (ikke bare legemidler), har tradisjonelt vært en del av farmakologien. Dette bringer også farmakologien i kontakt med andre fagfelt som bl.a. miljømedisin.